河南省在加快境内南水北调中线工程建设进度的同时，积极开展丹江口库区水源地及沿线水质保护工作，目前库区水质保护成效显著，丹江口水质长年稳定在Ⅱ类以上标准。
据介绍，为加强南水北调中线工程水质保护，河南省加强生态建设，加快了《丹江口库区及上游水污染防治和水土保持规划》项目实施步伐。目前，全省已实施项目35个，完成投资8.94亿元，治理水土流失面积1962平方公里，完成渠首植树造林535万亩，建设沼气池9万多个。
加强监测、监管，强化点源面源污染防治。据统计，河南省已关停并转南水北调中线水源地涉及的南阳、洛阳、三门峡3市801家污染企业，治理渠首尾矿23个，并在丹江口库区所在地淅川县建立了3个自动水质监测站和9个人工采样监测点，保证了出境断面水质达标。
完成了《南水北调中线一期工程总干渠(河南段)两侧水源保护区划定方案》的编制。按照方案，河南省将在南水北调中线(河南段)总干渠两侧划定水源保护区3054.43平方公里。目前，这一方案已进入执行阶段。
此外，南水北调中线工程渠首所在地的河南省淅川县正在以保护渠首环境为契机力促经济转型，努力打造包括生态农业、环保工业、生态城镇和旅游等体系在内的渠首生态经济示范区，确保南水北调中线水源地水质安全。
